单细胞数据展示 最近一段时间,实验室测了不少单细胞数据,为了方便实验室成员预览数据和调用数据,之前利用Shiny在服务器后台运行Rscript XX.R进行数据在线展示,但是现在一下子增加很多数据,就开始考虑部署服务器版的Shiny Server了。未发表数据肯定不能托管,而且数据量也较大,VPS那点能力也hold不了,最后决定在自己服务器上面部署。
需求:单细胞数据实验室内部展示 下载安装Shiny Server 官网安装服务器版本,参考官网步骤即可,提前安装好R和shiny等包。
sudo apt-get install gdebi-core wget https://download3.rstudio.org/ubuntu-14.04/x86_64/shiny-server-1.5.13.944-amd64.deb sudo gdebi shiny-server-1.5.13.944-amd64.deb 软件参数调试 #打开配置文件,直接在VScode中打开编辑即可。 大赞VScode!!!!!!VScode YES!!!!! /etc/shiny-server/shiny-server.conf # Instruct Shiny Server to run applications as the user "shiny" # 我改成了自己的账户,不需要新建立一个"shiny"用户 run_as 自己的用户名; access_log /var/log/shiny-server/access.